Shinji ikari
A harmadik tárgy, amelyet a Marduk Intézet választott ki, a harmadik gyermek. Ő félénk, zárkózott, kételkedik az értéke élete szokott lenni az egyik, és beleesik a depresszió megszökött otthonról, és élnek az utcán, alszik a moziban. Mivel apját elutasítja, úgy véli, hogy felesleges. Gyakorlatilag nincsenek barátai (csak a két iskolás baráta van a sorozatban - Kensuke Aida és Toji Suzuhara). Shinji pilóta munkája nem tetszik, és a show kétszer próbálja elhagyni a pilótaülését. Nem törődik azzal, hogy indifferens módon megvédje az emberiséget. Tehát, az első sorozat, amellett, hogy neki nem volt senki, hogy megvédje a várat város Tokió-3, de Shinji hajlandó kipróbálni, Evangelion, amíg fennáll a veszélye, hogy ez lesz bevezetni súlyosan megsérült Rei Ayanami. Az első gyermek. Szabadidő Shinji kitölti a csellót, és hallgatja a lejátszót. Különösen gyakran hallgatja a lejátszót, mert depressziós. Szintén jó szakács és mindenféle előkészítés nélkül ideális szinkronicitással rendelkezik a Rey-lel, ahol a szinkronizálás a második gyermek Asukával egy hetet vesz igénybe.
Annak ellenére, hogy hozzááll a munkához, Shinji egyedülálló képességekkel rendelkezik a kísérletezéshez. Még Ray Ayanami is hét hónapot vett igénybe, hogy szinkronizálhasson Eve-val, és a Shinji minden előkészület nélkül elérte a szinkronizálás 41,3 százalékát. Ezt követően Shinji több hónapig szüneteltetik az Asukat. annak ellenére, hogy korábban a legmagasabb szintű szinkronizáció volt a pilóták között és 10 évig edzett. Az angyalok különös érdeklődést mutatnak neki. Így Gagiyal, aki az első angyal, Adam és Eva-02 embrióját figyelmen kívül hagyta, miközben Németországban volt, megtámadta a flottát, amelyik hordta őket, amikor Shinji érkezett a hajóra. Bard, aki hozta le battleworthy Eva 00 és 02 pár másodpercig, Shinji fojtott engedékeny Éva egy ideig, ami elegendő Shinji Gendo ki, hogy megvitassák, hogy küzdeni kell Bardiilom és aktiválja a bábu, amelyet ezt követően elpusztult angyal. Zeruil, aki az Eve-00-ot és a 02-et egyetlen ütéssel eltörte, megpróbálta megtörni az Eva-01 magját ahhoz, hogy aktiválja a berserkert.
Végül az utolsó angyal, Kaoru Nagisa azt állította, hogy esetleg született, hogy találkozzon Shinjivel.
Közelebb a sorozat végéhez, ő, mint Ray. új testet kap. Amint azt a NERV szakértője, Ritsuko Akagi. folyamán egyszer a csata szívódott Shinji Evangelion-01, ami maradt Shinji teste oldott formában belül a bejegyzést dugó Evangelion, és ott lakozik a lélek. Shinji megmentése érdekében megpróbálják helyreállítani a testet, és összekapcsolni a lélekkel. Azonban a mentő kapszula tartalma kifolyt a padlóra, és így kicsapódik a néhány felszín alatti Evangelion Shinji nem eredeti test, és annak másolatát által generált Éva. Így a kettő az "Evangelion vége" vége előtt, ahol minden ember elveszíti testüket, és később megkapja a lehetőséget, hogy újakat szerezzen, továbbra is az egyetlen olyan szereplő, aki túlélte a reinkarnációt.