Humán mikro-humán
Humán mikroRNS: általános rendelkezések
Az emberi mikroRNS génjének lokalizálása és szerkezeti szervezése
Ha az emberi mikroRNS és az állatok génjei közötti homológiáról beszélünk, akkor meg kell jegyeznünk, hogy elég nagy. A mikroRNS gének állandósága különböző fajokban azt jelzi, hogy a kódolt funkciók konzervatívak. A kutatók kimutatták, hogy sok mikroRNS gén evolúciósan konzervatív, és némelyik hasonló a férgekben és az emberekben.
Emellett megjegyezzük, hogy a genom bizonyos helyein a mikroRNS-gének génjeinek vagy klasztereinek elhelyezése van:
közel az úgynevezett törékeny helyekhez (FRA) vagy belülük (1.
közel a HPV16 integrációs webhelyekhez;
közel a rákhoz társult régiókhoz (CAGR - rákkal segített genomiális régiók);
közel a homeoposzhoz (HOX) vagy azokhoz (2.
Elsődleges mikroRNS-ek előállítása és feldolgozása
Amint már említettük, a mikroRNS génjei nem különböznek szerkezetükben az mRNS-génektől és az elsődleges mikroRNS-ektől, és az mRNS-ek szerkezetben ekvivalensek. Az mRNS elsődleges átiratához hasonlóan a pri-miRNS sar és poliA-farokkal rendelkezik.
A pri-miRNS transzkripcióját az RNS-polimeráz II végzi. Az elsődleges átirat az RNS mérete
Ezzel szemben a Drosha olyan enzim, amely közvetlenül elő-feldolgozza és átalakítja a pri-miRNS-t a pre-miRNS-hez.
Annak érdekében, hogy egy pre-miRNS-t alakítson ki, a Droshának két betűvel kell előállítania a pri-miRNS-t. Ehhez a középső részén lévő enzimben két RIIID domén található, amelyek intramolekuláris dimereket képeznek. A RIIIDa az RNS-szálat a 3'-terminálisból és a RIIIDb-ből az 5'-terminálisból vágja le, és a bemetszéseket egymástól független tartományok alkotják. A mikroprocesszor komplex képes.
Ahhoz, hogy a komplex, hogy megtalálja a megfelelő részén pri-miRNS minden pri-miRNS kell egy másodlagos szerkezetet ami terminál hurok? 10 nukleotid, és a törzs hosszabb, mint a pre-miRNS generált a jövőben ebből a pri-miRNS . A Drosha képes elő-miRNS-t vágni a pri-miRNS-ből, ha a kapocs a terminális hurokkal 5 ' és 3? end nem komplementer nukleotidokkal. A Drosha sikeres felismeréséhez a méretüknek 7-13 nukleotidnak kell lennie az 5'-terminális és 10-30 nukleotid közül a 3'-terminálisból. Minél hosszabb az egyszerű 5-ös oldalak hossza? és 3? annál valószínűbb, hogy Drosha kivágja a hordó hurok szerkezetét.
Így a pri-miRNS feldolgozása a következő szakaszokra osztható:
A mikroprocesszor komplex DGCR8 a pri-miRNS törzsön helyezkedik el, és hozzá van kötve;
A Drosha P-gazdag régiója kötődik a csomagtartó tetejéhez (hurok);
Ennek eredményeképpen körülbelül 70 nukleotid pre-miRNS képződik, amelynek hurokja a törzs végén és két nukleotidnak a 3'-terminálison történő kiemelése.
A mikroRNS prekurzorok strukturális szervezése és feldolgozása
A pre-miRNS kialakulásának összes folyamata a magban történik.
A mikroRNS-hez való további átalakuláshoz a szerkezetnek a sejtmagot a citoplazmában kell hagynia. Annak érdekében, hogy az elő-miRNS ezt megtehesse, kapcsolatba kell lépnie az Exportin 5 nukleáris kiviteli tényezővel, amely a GTP-vel kötő ko-faktorral együtt jár. A komplex pre-miRNS / exportin 5 / Ran-GTP vándorol a citoplazmába, ahol GTP-hidrolízis következik, amely indukálja a kibocsátás előtti miRNS.
A szerkezet következő tulajdonságai befolyásolják a pre-miRNS-hez való kötődést: a) a törzs méretét; b) a 3'-terminális két nukleotidban lévő protuberancum jelenléte. A hurok méretei nem befolyásolják az Exportin 5 képes kommunikálni a pre-miRNS-sel.
Miután az elő-miRNS elválasztott az Exportin 5-től, Dicer belép. Dicer (molekulasúlya körülbelül 220 kDa) tartozik, az RN-áz III osztály 3 ilyen endonukleázok, és a következő funkcionális területek a molekulában: a) DEAD-box; b) RNS-helikáz / ATPáz domén; c) DUF283 - a funkciót nem ismerjük; d) PAZ; e) két RIIID (RIIIDa és RIIIDb) és e) dsRBD.
Az érett mikroRNS funkcionális szerepe
A mikroRNS kialakulását követően be kell építeni az effektor komplexbe, amelyet RISC néven ismerünk. A RISC egy komplex multienzim komplex (molekulatömege körülbelül 160 kDa).
A mikroRNS-ek gyakorlati alkalmazása funkcionális genomikában és génterápiában
Jelenleg az RNS-interferencia jelenségét intenzíven tanulmányozzák, és annak ellenére, hogy ezt a jelenséget viszonylag korábban fedezték fel, ma már nagyon kevesen ismertek róla. Az RNS interferencia az érdeklődés nem csak tisztán elméleti alapokon, amely lehetővé teszi, hogy megértsék bizonyos aspektusait működésének a genom, hanem szerepet játszhatnak egy eszköz, amellyel szabályozhatja külön gének, amelyek az igény megoldására alkalmazási terv funkcionális genomika és a génterápia. Ezen kívül még, hogy tanulmányozza a jelentősége ennek a jelenségnek az ilyen biológia epigenetikai, és megtalálja a helyét az evolúció RNS interferencia.
19. Vermeulen A. Behlen L. Reynolds A. Wolfson A. Marshall W. S. Karpilov J. Khvorova A. A hozzájárulások a dsRNS szerkezet Dicer specifitás és a hatékonyság // RNS
20. Weber J.M. Új humán és egér mikroRNS gének homológ kereséssel [FEBS Journal